北京工商大学研究生教育始于1979年，1981年成为国务院批准的全国首批具有硕士学位授权单位之一，2018年我校获批博士学位授予单位。现拥有应用经济学、系统科学、统计学、化学工程与技术、轻工技术与工程、食品科学与工程、工商管理学7个一级学科博士学位授予点，以及生物与医药1个博士专业学位授予点。

学校于2008年成立党委研究生工作部，与研究生部合署办公；2015年更名为研究生院（党委研究生工作部）；2019年进一步整合学科建设职能，调整为研究生院（党委研究生工作部、学科建设办公室），实行一体化运行。

党委研究生工作部负责研究生党建与思想政治教育、奖助管理、学术与实践活动组织、安全教育等日常教育管理工作，统筹研究生骨干队伍与辅导员队伍建设。

研究生院承担全校研究生教育的归口管理与质量保障，主要职责包括：制定研究生教育发展规划与教育教学规章制度；组织制定并实施培养方案与教学计划，落实全过程培养监管；负责博士、硕士研究生学籍管理、成绩与学位授予全流程管理；统筹研究生导师队伍建设，组织开展导师遴选、培训与考核。

学科建设办公室负责学校学科规划和建设，具体职能包括：组织编制学科规划与建设方案并监督实施；制定学科建设经费使用与管理制度；统筹学科布局及优化调整，组织学科设置与调整、学科评估及硕士博士学位授权点申报等工作。

研究生院（党委研究生工作部、学科建设办公室）在学校党委和行政的统一领导下，秉持“工商一体化”理念，与各学院及相关部门协同联动，以学校创建特色鲜明的高水平研究型大学为目标，聚焦高水平学科建设与研究生培养质量提升，全力推进“双一流”学科创建，落实立德树人根本任务，持续深化体制机制改革，推动学校学科建设与研究生教育实现高质量发展。